24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1582 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  26.69 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  33.6 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  32.02 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  28.46 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  35.57 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  26.29 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  29.41 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  29.55 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  30.66 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  29.92 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  29.82 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  29.34 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  29.8 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  26.94 
 
 
220 aa  45.4  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  36.26 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  37.8 
 
 
371 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  36.99 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  41.51 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  32.67 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  24.32 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  38.6 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 
384 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  28.17 
 
 
390 aa  42  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>