49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0341 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  533  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  29.84 
 
 
258 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  31.28 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  25.78 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  27.64 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  28.74 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  22.96 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  28.02 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  27.65 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  29.27 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  26.06 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  24.22 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  25.08 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  24.91 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  25.6 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  25.21 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  23.97 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  26.48 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  31.52 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  46.88 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  28.37 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.82 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  25.95 
 
 
313 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  35.71 
 
 
476 aa  52.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2017  hypothetical protein  37.31 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3193  putative transmembrane anti-sigma factor  38.78 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.07 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  26.32 
 
 
210 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  23.92 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  29.11 
 
 
241 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  27.64 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3942  putative transmembrane anti-sigma factor  34.15 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.248924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  24.5 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  22.94 
 
 
277 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  38.18 
 
 
244 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.73 
 
 
360 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  24.03 
 
 
329 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  24.9 
 
 
220 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  25.11 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  25.11 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0287  putative transmembrane anti-sigma factor  22.14 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.777586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  27.54 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  39.02 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  32.53 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  30.97 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  34.88 
 
 
262 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>