30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3433 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  37.8 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  36.51 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  37.6 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  33.2 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  35.69 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  32.37 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  32.78 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  42.39 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  32.92 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  32.92 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  32.92 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.7 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  30.42 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  35.32 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  36.19 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  31.17 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  31.87 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  32.41 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  23.74 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  35.63 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.96 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  37.7 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  32.95 
 
 		 476 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  25.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>