27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10449 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  59.74 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  60.08 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  60.08 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  60.08 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  56.9 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  37.98 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  38.68 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  31.62 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  31.51 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  38.33 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  29.88 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  38.81 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  32.13 
 
 
233 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  28.4 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  28.46 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  29.75 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  28.63 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  28.33 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  23.74 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  45.45 
 
 
276 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  36.9 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  33.55 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  38.52 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  29.58 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  27.46 
 
 
277 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  25 
 
 
214 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>