48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5902 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  37.2 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  36.89 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  38.49 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  38.68 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  37.87 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  33.2 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  36.21 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  32.93 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  33.46 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  33.46 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  33.46 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  36.89 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  34.12 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  31.35 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  30.89 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  38.6 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  27.89 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  29.66 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  36.52 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.69 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  29.24 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  25 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  40.66 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  23.58 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  21.07 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  27.04 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0287  putative transmembrane anti-sigma factor  25 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.777586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  35.94 
 
 		 363 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  26.49 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  22.22 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  31.15 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  32.86 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  27.24 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  21.94 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  37.25 
 
 		 390 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  35.79 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  27.92 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  30.59 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  25.22 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  24.23 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  31.65 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  34.07 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  35.94 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>