32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1817 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  77.64 
 
 		 238 aa  345  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  66.53 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  66.53 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  66.53 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  59.74 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  41.09 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  38.93 
 
 		 253 aa  134  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  34.8 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  35.41 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  33.2 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  30.8 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  32.92 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  30.58 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  31.17 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  29.88 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  33.2 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  27.67 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  34.23 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  28.38 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  23.68 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  29.5 
 
 		 476 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  33.7 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.91 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  34.41 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  29.12 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  36.7 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  28.15 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  41.89 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  30.34 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  30.21 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  31.03 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>