34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0607 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  100 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  32.66 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  33.67 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  31.84 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  31.84 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  27.71 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  30.58 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  40.37 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  29.52 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  30.86 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  41.79 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  38.96 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  32.08 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  26.75 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  26.32 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  32.56 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  32.03 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  29.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  31.73 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  28.47 
 
 		 476 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  30.41 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  28.03 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  28.14 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  29.66 
 
 		 297 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  31.43 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  31.96 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  23.29 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  36.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  34.06 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  41.27 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  35.6 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  31.4 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  29.31 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>