44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3537 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  35.14 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  30.91 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  31.72 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  36.6 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  30.45 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  27.1 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  29.18 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  32.2 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  32.2 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  29.22 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  27.17 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  27.71 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  35.02 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  33.19 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  31.88 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  32.74 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  27.47 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  28.99 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  29.39 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  31.42 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  30.36 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  31.96 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  25.74 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  26.89 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  30.4 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  52.08 
 
 		 696 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  30.38 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  28.21 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  32.99 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  24.34 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  28.07 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  30.28 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  29.69 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  25.1 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  27.56 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.4 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  30.13 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  25.36 
 
 		 294 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  42.86 
 
 		 299 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>