55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3980 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  78.05 
 
 		 246 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  42.52 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  36.29 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  37.8 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  37.96 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  31.7 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  27.64 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  32.39 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  47.06 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  32.81 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  29.37 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  29.37 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  29.37 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  30.8 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  27.54 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  31.35 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  29.76 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  33.61 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  30.17 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  32.79 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.57 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  23.91 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  36.67 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  27.2 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  46.15 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  29.79 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  26.29 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  57.5 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25.51 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  30.58 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  26.86 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  44.23 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2017  hypothetical protein  27.75 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  39.39 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  25.55 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  24.23 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  53.49 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  27.87 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3193  putative transmembrane anti-sigma factor  35.62 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.45 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  53.66 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  28.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  30.98 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  37.66 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  43.18 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  47.73 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  22.01 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  38.36 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  26.86 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  22.41 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  42.55 
 
 		 223 aa  42  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  27.93 
 
 		 253 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>