24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1677 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  32.67 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  35.51 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  33.04 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  32.6 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  32.6 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  34.92 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  36.89 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  34.65 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  34.45 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  36.11 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  31.51 
 
 		 273 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  29.96 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  31.4 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  59.62 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  30.31 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  28.21 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  57.45 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  29.36 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  35.59 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  43.42 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  51.28 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>