9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8247 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 235 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  25.83 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  31.67 
 
 		 393 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  52.08 
 
 		 318 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  24.7 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  32.86 
 
 		 403 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  42.37 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>