24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5953 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  31.84 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  53.33 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  57.78 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  29.48 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  43.86 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  55.32 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  52.38 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  49.06 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  34.69 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  48.84 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  48.78 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  46.51 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  39.34 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  46.34 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  60 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  38.98 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  43.18 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  37.29 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  36.62 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  52.63 
 
 		 62 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  52.38 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  51.52 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>