29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0939 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  28.74 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  28.7 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  31.78 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  35.24 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  26.14 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  51.22 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  38.89 
 
 		 363 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.73 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  54.05 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  45.21 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  37.11 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  29.75 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25.41 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2023  hypothetical protein  29.82 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00757255  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  40.91 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 		 318 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  61.76 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  31.16 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  20.85 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  30.21 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  29.58 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  21.88 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  54.55 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.82 
 
 		 267 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  54.29 
 
 		 376 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>