39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0599 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  34.94 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  29.56 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0457  putative transmembrane anti-sigma factor  30.04 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.327804  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  29.69 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  57.78 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5369  putative transmembrane anti-sigma factor  27.69 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  50.98 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  44.16 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  33.64 
 
 		 363 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  27.34 
 
 		 329 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  43.64 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3942  putative transmembrane anti-sigma factor  45.33 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.248924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  40.28 
 
 		 91 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0405  hypothetical protein  43.84 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0999853  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  35.59 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  26.06 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  56.1 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  28 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  51.22 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  55.88 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  41.18 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  37.74 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  41.1 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.5 
 
 		 360 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  44.23 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  25.48 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4073  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00000644003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  27.83 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3509  putative transmembrane anti-sigma factor  47.06 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  32.77 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  24.05 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  24.05 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.56 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  25.23 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  23.63 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 313 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  39.68 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>