34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0227 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.35 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.11 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  37.14 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.27 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  60.53 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  40.58 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  42.03 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  56.82 
 
 
62 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  38.98 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0287  putative transmembrane anti-sigma factor  29.13 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.777586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  43.86 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  24.25 
 
 
246 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  26.5 
 
 
262 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  43.86 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  30.53 
 
 
318 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  43.86 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  48.89 
 
 
250 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  52.5 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  32.86 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3193  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  34.33 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  40 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  39.39 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  20.58 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2151  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 
171 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  38.64 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  37.88 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  26.76 
 
 
237 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  39.06 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>