18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1994 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  30.28 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  30.29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  74.47 
 
 		 62 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  28.74 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  31.35 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5369  putative transmembrane anti-sigma factor  29.88 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  60.53 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  47.92 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  25.1 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0457  putative transmembrane anti-sigma factor  29.32 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.327804  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  45.45 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  50 
 
 		 255 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>