14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5023 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  30.95 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  29.96 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  41.54 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  27.8 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  55 
 
 		 62 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  29.29 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  29.29 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  26.01 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  26.47 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  38.98 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  26 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  48.94 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>