35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0521 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  34.35 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  30.17 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  30.96 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  32.52 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  52.83 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  26.67 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  25.52 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  51.06 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  48 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  25.32 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  31.87 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  41.54 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  28.33 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  52.08 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1911  hypothetical protein  28.28 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0913503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  46.43 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  28.12 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1860  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.048988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1604  group-specific protein  27.27 
 
 		 147 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1837  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  60 
 
 		 246 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1800  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.421376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  38.03 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1635  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000630632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1657  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  57.14 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1788  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  25.21 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1654  hypothetical protein  26.26 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3193  putative transmembrane anti-sigma factor  46.81 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3541  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>