39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0058 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 223 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  38 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 270 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  32.79 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  30.04 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  28.08 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  36.11 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  28.64 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  28.64 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  28.64 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  32.2 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  32.57 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3942  putative transmembrane anti-sigma factor  31.36 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.248924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  26.05 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  50.85 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  26.61 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1186  putative transmembrane anti-sigma factor  30.05 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5369  putative transmembrane anti-sigma factor  27.75 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  42.53 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  27.88 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  31.11 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 146 aa  48.9  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 363 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  52.63 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3788  putative transmembrane anti-sigma factor  30.81 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  48 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  41.38 
 
 		 371 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0273  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 135 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287292  normal  0.724459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3384  hypothetical protein  29.26 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455672  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  24.3 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  42 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.78 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  32.63 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3509  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  43.75 
 
 		 318 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  25.53 
 
 		 384 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  48.72 
 
 		 255 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>