49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4536 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  37.96 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  37.87 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  39.02 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  36.51 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  39.04 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  33.84 
 
 		 294 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  37.88 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  33.61 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  36.1 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  32.02 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  34.45 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  35.39 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  35.39 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  35.39 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  34.82 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  34.63 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  45.54 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  32.28 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  30.2 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  27.67 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  29.22 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  31.33 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  30.47 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25.1 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 390 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  29.41 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  29.75 
 
 		 476 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  29.2 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  37.93 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.47 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  25.47 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  24.9 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  21.86 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  34.52 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  27.89 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  38.36 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  20.19 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.11 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  25.42 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  34.94 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  29.54 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2432  hypothetical protein  31.31 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  45.45 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  43.18 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  44.44 
 
 		 244 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0472  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>