17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5369 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5369  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  30.34 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  28.87 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  30.58 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  28.19 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  31.09 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  27.59 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0405  hypothetical protein  30.33 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0999853  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  26.21 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  51.16 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  46.81 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  40 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0457  putative transmembrane anti-sigma factor  31.82 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.327804  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  39.58 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  28.45 
 
 		 239 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  45.45 
 
 		 258 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>