23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1801 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  36.96 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  31.4 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  31.4 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  31.4 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  30.68 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  32.11 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  28.91 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  55.07 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  48.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  53.23 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  30.51 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  61.7 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  28.69 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  49.09 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  55.32 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  50.85 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  33.81 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5444  putative transmembrane anti-sigma factor  38.6 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0459654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  54.55 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  68 
 
 		 277 aa  42  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08330  hypothetical protein  44 
 
 		 263 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0824478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>