31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0899 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  30.48 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0457  putative transmembrane anti-sigma factor  40.49 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.327804  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  47.37 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5369  putative transmembrane anti-sigma factor  30.34 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  46.88 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  28.46 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  43.4 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  46.43 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  34.09 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  38.89 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  43.84 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  52.08 
 
 		 62 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  41.18 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3942  putative transmembrane anti-sigma factor  42.25 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.248924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  38.98 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.86 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  34.25 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  44.78 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  25.66 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  32.73 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0069  hypothetical protein  29.25 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0405  hypothetical protein  39.44 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0999853  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  39.39 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  41.51 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  63.16 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  38.98 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  44 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>