23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1351 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  76.62 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  62.82 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  62.39 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  62.39 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  38.43 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  37.05 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  31.43 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  32.54 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  54.55 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  57.35 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  62.26 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  31.65 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  48 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  25.97 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  39.47 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1994  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000192498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  57.14 
 
 		 62 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  31.52 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  27.36 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  39.77 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  37.8 
 
 		 245 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>