26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4445 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  36.75 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  30.17 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  34.8 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  29.96 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  31.47 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  30.3 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  30.3 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  30.3 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  67.92 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  32.08 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  28.95 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  62.26 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  61.7 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  50.88 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  44.16 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3788  putative transmembrane anti-sigma factor  31.6 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3942  putative transmembrane anti-sigma factor  27.93 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.248924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  37.1 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5369  putative transmembrane anti-sigma factor  28.27 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  63.64 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  29.81 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  28.95 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  60.61 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>