24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10750 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  43.97 
 
 
239 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  43.97 
 
 
239 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  43.53 
 
 
239 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  42.92 
 
 
238 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  41.95 
 
 
234 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  36.91 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  29.34 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  52.11 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  31.75 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  54.72 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  31.44 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3788  putative transmembrane anti-sigma factor  31.4 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  32.59 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  26.16 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  41.46 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8247  putative transmembrane anti-sigma factor  26.05 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  47.83 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  42.25 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  41.18 
 
 
247 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  23.53 
 
 
329 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  51.06 
 
 
62 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  44 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>