38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1668 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  461  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  29.8 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  31.8 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  26.36 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.45 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  29.69 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  28 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  30.52 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  29.37 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  28.63 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  27.73 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  28.09 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  27.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  33.33 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  37.14 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  28 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  29.44 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  29.88 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  25.95 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  27.83 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  38.03 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  26.78 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  29.83 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  27.92 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  23.02 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  39.24 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.43 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  22.88 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  40.26 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  34.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  34.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  34.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  30.16 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  27.46 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  40.32 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  44 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  34.33 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  38.16 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>