28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12213 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  44.32 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  26.76 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  28.15 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  28.06 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  27.74 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  26.52 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  22.76 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  37.08 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  36.14 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  29.31 
 
 		 476 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  23.4 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  24.49 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  25.68 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  29.27 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  30.95 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0900  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  29.89 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  32.53 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  40.32 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  40.32 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  40.32 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  37.5 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  24.62 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  37.33 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  31.51 
 
 		 248 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>