31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4208 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  31.12 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  34.05 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  31.45 
 
 		 242 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  38.35 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  26.48 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  31.88 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  30.77 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  30.95 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  37.8 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  40.86 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  31.21 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  38.89 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  40.34 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  38.89 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  38.89 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  30.58 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  34.78 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  32.61 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  33.7 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  34.51 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  30.38 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  40.79 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  39.29 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  29.61 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.03 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  39.24 
 
 		 240 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  36.9 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  27.62 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  35.16 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  44 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>