13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2946 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  44.32 
 
 
264 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  34.39 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  28.48 
 
 
297 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  29.29 
 
 
294 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  26.35 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  28.42 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  25.86 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  33.06 
 
 
294 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  37.01 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.58 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  31.58 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  30.49 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>