35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2738 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  64.55 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  35.34 
 
 		 237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  38.06 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  38.06 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  38.06 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  34.96 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  35.82 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  46.62 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  28.62 
 
 		 476 aa  85.5  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  33.83 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  33.58 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  28.73 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  31.03 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  29.81 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  32.82 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  27.17 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  37.08 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  36.56 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  29.15 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  25.52 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  34.91 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.08 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  40.21 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  27.86 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  34.35 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  25.59 
 
 		 210 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  38.46 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  33.06 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  26.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  35.63 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  39.42 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  26.32 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  34.78 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>