31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4372 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  66.53 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  67.49 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  60.08 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  46.64 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  35.68 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  37.27 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  36.68 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  34.65 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  31.2 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  31.45 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.98 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  29.87 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  33.2 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  34.98 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  38.89 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  27.83 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  34.23 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  32.11 
 
 		 476 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  31.74 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  26.34 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  25.55 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  27.36 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  40.32 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.7 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  34.25 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  26.98 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  29.55 
 
 		 244 aa  42  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>