70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3590 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  41.74 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  35.37 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  35.37 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  36.61 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  32.38 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  39.83 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  39.83 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  33.46 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  29.6 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  34.88 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  38.31 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  32.39 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  34.98 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  32.28 
 
 		 260 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  30.9 
 
 		 302 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  31.54 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  32.64 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  30.62 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  30.87 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  31.76 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  32.92 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  32.46 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  32.61 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  35.86 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  32.24 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  32.24 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  35.86 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  30.74 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  31.95 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  40.18 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  30.45 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  32.92 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  32.92 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  31.85 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  32.77 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  30.04 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  31.49 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  32.34 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  29.84 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  27.57 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  28 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  31.38 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  28.16 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  28.45 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  29.26 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  38.89 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  29.28 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  31.48 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  28.75 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  52.38 
 
 		 696 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00553  hypothetical protein  26.87 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  27.74 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  32.13 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  27.24 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  26.86 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  30.21 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  31.42 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  31.42 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  31.42 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0549  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0563  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000011277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  30.95 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  37.88 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>