59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3920 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 		 241 aa  453  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  51.28 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  51.69 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  48.9 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  41.63 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  38.08 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  40.66 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  31.93 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  34.14 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  35.02 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  35.02 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  31.23 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  31.51 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  39.22 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  35.96 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  36.24 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  33.48 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  37.77 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  35.25 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  31.56 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  37.18 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  36.05 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  41.82 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  33.05 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  30.3 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  33.92 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  33.77 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  33.77 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  33.2 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  31.03 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  30.21 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  37.55 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  29.61 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  32.03 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  27.68 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  33.62 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  32 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  31.98 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  56.06 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  29.32 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  56.06 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  31.97 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  30.04 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  30.45 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  27.68 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  42.86 
 
 		 299 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  48.53 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  30.49 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  43.55 
 
 		 696 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  34.6 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  25.74 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00553  hypothetical protein  29.73 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>