52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1085 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  52.16 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  42.64 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  42.64 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  39.92 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  39.33 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  37.26 
 
 		 242 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  33.58 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  33.46 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  36.19 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  33.06 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  33.53 
 
 		 171 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  31.3 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  29.64 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  31.92 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  29.46 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  30.89 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  30.65 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  27.76 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  28.52 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  28.52 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  29.77 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  29.77 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  31.73 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  33.46 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  32.9 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  36.72 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  26.84 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  29.72 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  28.96 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  29.53 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  29.27 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  28.41 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  28.41 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  26.61 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  26.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  27.24 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  30.16 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  26.42 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  28.63 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  25.1 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  29.5 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  26.24 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  23.92 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  27.13 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  37.5 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  25.1 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  24.24 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>