15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0636 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  100 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  33.53 
 
 		 260 aa  94  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  32.74 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  29.89 
 
 		 242 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  33.87 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  29.68 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  33.87 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  33.87 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  29.2 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  26.13 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  33.03 
 
 		 258 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  26.62 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  26.72 
 
 		 328 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  29.66 
 
 		 254 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>