50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1826 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  68.87 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  67.94 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  58.73 
 
 		 294 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  57.36 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  31.35 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  30.92 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  43.44 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  30.03 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  43.12 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  42.61 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  30.84 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  27.61 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  41.44 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  29.57 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  29.57 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  27.03 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  26.96 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  40 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  29.79 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  26.73 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  23.92 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  22.71 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  30.83 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  25.74 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  38.26 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  30.25 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  24.67 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  36.84 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  25.83 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  37.61 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  28.31 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  41.67 
 
 		 696 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  44.29 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  44.29 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  25.17 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  29.66 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  25.68 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  39.36 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  27.35 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  38.05 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  40.54 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  27.73 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>