62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3548 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  37.55 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  37.55 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  36.19 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  39.46 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  39.83 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  41.7 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  36.44 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  32.38 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  38.84 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  38.84 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  36.59 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  36.48 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  33.07 
 
 		 260 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  33.9 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  34.91 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  33.62 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  36.82 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  33.61 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  34.06 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  38.2 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  32.13 
 
 		 275 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  31.36 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  31.36 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  34.2 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  31.88 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  32.81 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  31.4 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  37.18 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  33.77 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  38.96 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  32.75 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  31.4 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  29.64 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  32.61 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  30.53 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  31.6 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  29.29 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  29.79 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  32.61 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  29.5 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  32.58 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  35.29 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  30.93 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  26.97 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  43.37 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  47.37 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  32.77 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  30.34 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  36.52 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  35.91 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3981  hypothetical protein  29.59 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.822328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  30.49 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  41.43 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  41.43 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00553  hypothetical protein  30.97 
 
 		 253 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  50 
 
 		 696 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  27.59 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  28.63 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>