31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3700 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  30.71 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  30.94 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  30.04 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  29.32 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  29.6 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  28.31 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  29.03 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  30.34 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  28.34 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  26.96 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  45.98 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  28.05 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  26.42 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  33.91 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  39.34 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  43.24 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  49.15 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  39.02 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  39.34 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00553  hypothetical protein  24.15 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  42.37 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  42.37 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  25.3 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  39.34 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  35.44 
 
 		 328 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  39.77 
 
 		 315 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>