25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3491 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  100 
 
 		 696 aa  1276    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  47.14 
 
 		 328 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  39.18 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  42.47 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  41.79 
 
 		 294 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  43.9 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  40.38 
 
 		 243 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  40.38 
 
 		 243 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  44.3 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  43.28 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  42.86 
 
 		 248 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  41.94 
 
 		 277 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  51.56 
 
 		 233 aa  54.7  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  45.59 
 
 		 259 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  45.59 
 
 		 259 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  41.94 
 
 		 244 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  41.98 
 
 		 260 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  36.56 
 
 		 260 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  52.08 
 
 		 234 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  41.94 
 
 		 315 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  43.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  42.03 
 
 		 230 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  53.49 
 
 		 234 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  40.74 
 
 		 229 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>