15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0288 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  27.31 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  25.35 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  28.18 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  24.57 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  24.57 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  28.4 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  27.35 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  28.02 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  27.16 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  25.54 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  30.49 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  27.15 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  27.95 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>