54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0549 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0563  major facilitator transporter  100 
 
 		 369 aa  727    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000011277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0549  major facilitator transporter  100 
 
 		 369 aa  727    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  23.75 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0463  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.44223  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 		 438 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  22.78 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1269  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 411 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 390 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  26.57 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  22.94 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  19.76 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  21.17 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  23.06 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1529  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.324526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 552 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.06 
 
 		 474 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  22.6 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  21.64 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  19.64 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 554 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 443 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  19.75 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  18.05 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>