25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2777 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  37.78 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  42.86 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  30.22 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  32.08 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  29.61 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  38.81 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  32.48 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  29.5 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  24.9 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  35.04 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  47.27 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  31.03 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  31.03 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  31.03 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  35.71 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  27.54 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.91 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  43.75 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  34.78 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  38.67 
 
 		 412 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  41.27 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1792  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  30.28 
 
 		 336 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  38.33 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>