25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0097 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  41.63 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  46.25 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  46.25 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  46.25 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  41.34 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  39.15 
 
 		 232 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  35.06 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  35.06 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  49.07 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  37.88 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  31.33 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  30.17 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  35.19 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  34.91 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  29.55 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.37 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.51 
 
 		 476 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  36.63 
 
 		 292 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  36.19 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  33.33 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  29.27 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  31.76 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  29.83 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  41.67 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>