30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3758 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  550  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  34.2 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  31.27 
 
 		 246 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  31.8 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  37.45 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  30.99 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  38.83 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  31.39 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  35.38 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  29.45 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  28.86 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  43.96 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  31.6 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  31.6 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  31.6 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  31.93 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  38.32 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  47.37 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  37.5 
 
 		 476 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  35.96 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  39.02 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  27.68 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  24.68 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  34.25 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  35.29 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  24.35 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  45.24 
 
 		 660 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>