30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3720 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  100 
 
 		 285 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  31.03 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  30.37 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  38.6 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  30 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  29.39 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  26.81 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  37.5 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  30.65 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  30.65 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  30.65 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  39.25 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  29.28 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  38.32 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  37.36 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  36.67 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  41.79 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  36.94 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  43.48 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  32.18 
 
 		 476 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  28.62 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.19 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  26.26 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  32.79 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  41.89 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  32.65 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  34.33 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  32.43 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>