28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1110 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  50.23 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  36.02 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.55 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  32.44 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  31.96 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  30.17 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  23.67 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  27.98 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  26.05 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.83 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  26.32 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  26.29 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  27.48 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  25.88 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  32.88 
 
 		 318 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  26.2 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  24.78 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  25.63 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  26.26 
 
 		 285 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  28.63 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  26.81 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  42.11 
 
 		 792 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  27.63 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  40.32 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  25.1 
 
 		 244 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>