17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4651 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  34.81 
 
 
291 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  29.55 
 
 
318 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  30.93 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  26.45 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  28.36 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  29.27 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  26.67 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  25.28 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  25.56 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  24.39 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2005  hypothetical protein  23.86 
 
 
273 aa  45.4  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  22.27 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  26.18 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>