14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0937 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 205 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  47.55 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  33.65 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  35.18 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  32.56 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  33.33 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  23.55 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  28.96 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  29.63 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  27.08 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  30.83 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  26.72 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  22.96 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  28.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>