30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4928 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  77.64 
 
 		 237 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  68.16 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  68.16 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  68.16 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  59.05 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  42.69 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3588  Anti-sigma-K factor RskA  39.18 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  36.86 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  32.81 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  32.51 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  35.27 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  31.33 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  32.24 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  33.88 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  29.48 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  36.36 
 
 		 476 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  35.4 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  34.78 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  24.02 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  27.01 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  29.96 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  27.76 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  32.18 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  31.25 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  39.73 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  24.7 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  37.63 
 
 		 291 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>